「認証」と「登記」は両方必要なのですか？

主務官庁に申請して認証を受けただけではＮＰＯ法人として成立したことにはなりません。
認証を受けた後、登記をすることによってはじめてＮＰＯ法人として成立します。

また、法人格を取得した後も、定款変更や理事の交代等によって、変更の登記を申請しなければならない場合があります。
登記は、法人の成立要件であり、第三者に対抗するための要件でもあります。

ＮＰＯ法人制度においては、主務官庁による認証という側面のほかに登記という手続きがあることに注意が必要です。